Профессиональная деятельность Германа Карельского, связанная с трансперсональной психологией, началась в 1992 году. Будучи директором «Центра психокоррекции», он организовывал в Москве семинары ведущих отечественных и зарубежных психологов.
С 1994 года Герман стал самостоятельно проводить тренинги и конференции по дыхательным психотехникам. В это же время им, совместно с Алексеем и Татьяной Саргунасами (центр «АКВА»), была разработана совместная обучающая программа по духовному акушерству и перинатальной психологии. В течение двух с половиной лет Герман Карельский проводил семинары по подготовке профессионалов в этой области.
В 1996 году объединённая команда специалистов среди которых были Г. Карельский , А. и Т. Саргунас, Д. и С. Акимовы, М. Пайст и др. приняла активное участие в создании холистического центра «Пангея».
Герман стал одним из тех, кто во многом способствовал возвращению в Россию «опального» Игоря Чарковского и приезду в 1996 году в РФ известного специалиста по альтернативному акушерству Мишеля Одена, который прочитал в Москве курс лекций и стал участником первой международной конференции «Акушерство Духа».
С 1997 года Герман Карельский руководит проектом «Сталкер», в рамках которого, объединяющий трансперсональных психологов, проводятся конференции и обучающие тренинги по интегративным психотехнологиям и осуществляется реабилитационная работа с наркоманами.
В 2001 году программа реабилитации наркозависимых, разработанная Германом Карельским, Галиной Лабковской и Ириной Зингерман, и основанная на трансперсональных психотехниках и древних духовных практиках, получила диплом ВВЦ и выиграла грант Правительства Москвы на внедрение в Северо-Западном административном округе столицы. Эта программа стала самой эффективной программой по работе с наркоманами (выход на годовую ремиссию наркозависимых составлял 60 % против обычных 5-10 %).
В 2006—2007 годах Герман прошёл обучение у шаманов Перу. В эти же годы начал активно проводить консультационную работу и тренинги в США, Великобритании и Турции.
В 2008 году Герман стал сертифицированным трансперсональным психотерапевтом Европейского Реестра EUROTAS, а в 2009 году он завершил обучение у Станислава Грофа и Тэва Спаркса и сертифицировался как ведущий холотропного дыхания международной программы Grof Transpersonal Training (GTT).
С 2014 года Герман Карельский занимает должность Президента Российской Ассоциации Трансперсональной Психологии и Психотерапии. Проводит конференции, тренинги по России и в Латвии, ведёт частные консультационные приёмы, а также выступает на телевидении.
В 2015 году награждён дипломом члена-корреспондента Международной Академии Психологических Наук и в декабре этого же года Герман получает повышение квалификации по сексологии.
В настоящее время, Герман Карельский преподаёт в Институте психоанализа (Москва) и Институте коучинга (Санкт-Петербург).